海马是会分公和母的，分辨的方法也是比较简单的，从大小上就能看出差异，还有明显的不一样，只要仔细的观察就能看出来。
雄性海马有突出的育籽囊，从腹部开始，一只延伸到尾巴开始的部位，而雌性海马没有。
雄海马的尾部腹面有一育儿囊(位于肛门后端)，该囊是当第一次生殖来临时，由尾部腹面左右伸出的皮招接合而成，只留未端小孔。雌鱼的泄殖腔未端在产卵期中也多少膨大，形成生殖乳突。此外，雄海马的个体一般比雌鱼稍大些。栖息和运动海马因其拟态适应特性，习性也较特殊，喜栖于藻丛或海韭菜繁生的潮下带海区。性甚懒惰，常以卷曲的尾部缠附于海藻的茎枝之上，有时也倒挂于漂浮着的海藻或其它物体上，随波逐流。
分辨海马的公母并不难，但是要更加深入的了解它们才行。
