种阿富汗猎犬的好坏直接影响其繁殖犬。俗话说“好种出好苗”，一定要选择那些无退化现象、神经类型稳定、体质健壮、生长发育快，抗病力强，繁殖力高的阿富汗犬做种用。
选择种公阿富汗犬时，宜选择雄威强壮、生殖器官无缺陷、阴囊紧系，精神充沛，性情和顺，配种时能紧追母阿富汗犬，并频频排尿。若配种时，出现不排尿，不愿爬跨母犬，交配无力，交配时间短或者性成熟后，两侧睾丸尺寸不一，或只有一睾丸，不能作种用。
种母犬宜选择健康无病，生殖机能健全，产仔多，带仔好，有四对以上发育有效的乳头，泌乳能力强，母性好的母犬。母性好的母犬表现为分娩前会絮窝，产后能及时给仔犬哺乳，一个月后会呕吐食物喂给仔犬，仔犬爬出窝外后能用嘴将其衔回等。
配种时要选择最佳时间，一般在发情后9~13天，老弱阿富汗犬进间稍提前一点，青壮年阿富汗犬稍靠后一点。采用“双重配”或“重复配”，这样可以增加母阿富汗犬卵细抱的受精机会和增多受精卵的数量，从而提高繁殖力。
