虽然阿富汗猎犬身体健康，平时很少生病，但这并不代表狗狗没有气人方面的问题，犬主人要留意狗狗的皮肤方面的疾病。
在爱犬的皮肤问题上，最常发生的就是异位性皮肤炎的问题，而且好发在母犬身上，从六个月大开始一直到七岁之前都很容易发生；此外，在迷你爱犬身上，还容易患有一种名为爱犬粉刺症的疾病。
爱犬的皮肤生性敏感，很容易因为洗毛精清洁不完全或过敏，而引发表浅化脓性坏死性皮肤炎，或是因为对磺胺剂类型药物过敏，而造成皮肤发炎的现象；除此之外，爱犬也容易患有糖尿病以及低甲状腺功能症方面的内分泌问题。
在胃肠道方面，则容易发生先天性肝门脉分流、以及出血性胃肠炎（通常好发于两岁至四岁之间）。这种出血性胃肠炎不是病毒造成的，较容易发生在迷你型爱犬身上，而就大型爱犬来说，因为 们对于维他命B12会有吸收不良的问题，而且非常有可能会造成不再生性的贫血现象（通常好发于六周至十二周的狗狗身上），饲主要特别注意。
