小林姬鼠的日常管理是非常关键的，一旦发现问题就要及时处理。以下是小林姬鼠常见的疾病和治疗方法：
1、腹泻：喂食的食物不洁，(指霉变腐败的食物）会导致小林姬鼠产生腹泻，其症状是稀样粪便不成粒状，有些异味。主人可以把小林姬鼠单独隔离，并喂一些土霉素及消炎抗菌的药，3天左右就会好。
2、伤寒感染：是由于冷热交替，小林姬鼠受寒所发生的肺部炎症，大多属于细菌感染，发病时，轻者只是鼻孔流出清淡的液体，不怎么吃食物。严重时，小林姬鼠的眼角眼屎增多，并发出粗重的喘息声，此时如不及时处理，小林姬鼠10-15天就会死亡，可用青霉素及抗生素喂食。
