青海田鼠体形中等，耳小，尾短，爪强大。吻部短，耳小而圆，其长不及后足长。尾长约为体长之1/4左右。四肢粗短，爪较强大，适应于挖掘活动。
青海田鼠躯体背毛较长而柔软。鼻端黑褐色。体背毛暗棕灰色，其毛基灰黑色，毛端棕黄色，并混杂有较多黑色长毛。腹面毛色灰黄，毛基灰黑色，毛端淡黄或土黄色。耳壳后基部具十分明显的棕黄色斑。尾明显二色，上面毛色同体背，下面为沙黄色，尾端具黑褐色毛束。前后足毛色同体背或稍暗，足掌及趾（指）为明显的黑色。爪黑色或黑褐色。
青海田鼠头骨较粗壮。上颌骨突出于鼻骨前端，鼻骨前端不甚扩大。眶间部显著狭缩，左右眶上嵴紧相靠近至相互接触。颧弓较粗壮。腭孔显，较粗大，腭骨后缘有小骨桥与左右翼骨突相联。
