青海田鼠对食物的选择随季节而变化。6月中旬以前喜食萎陵菜的根茎；6月中旬以后喜食苔草、嵩草、披碱草、针茅等植物的绿色部分。青海田鼠日食鲜草26~38g，约为体重的一半。
青海田鼠栖息于海拔3700-4800m的沼泽草甸地带及高山草甸草原、高寒半荒漠草原带，喜选择疏丛型草地及灌丛草地等气候温和、土壤疏松、牧草比较丰茂、具有嵩草、萎陵菜、苔草、沙草的草地作为栖息位点。
青海田鼠具有较强的迁移习性，迁移距离可达数公里以外，故其栖居地不甚稳定。在其分布地带，有效洞口的数量变动可相差几十至几百倍，这与其经常性的迁居有关。
