硝化菌
鱼的排泄物堆积会产生有毒的氨，而硝化菌主要是用来分解让水质恶化的氨，经分解后会变成亚硝酸盐及硝酸盐。硝化菌的培养应该是在滤水系统中培养的，而不是在水中培养，在过滤系统中滤材的放法也很重要的，不正确的方法，让事倍而功半。
以上层过滤系统为例，陶瓷环与生化环要放在最底部，其上层再放一层生化棉，这就构成了简单的硝化菌培养温床，再者才是一般所使用的白棉，每次滤材更换时，所更换的是最上层的白棉。而生化棉与陶瓷环、生化球，约半年洗一次，以保水量畅通。但生化棉，陶瓷环与生化球不要一起清洗，而是要清洗完放回水器后再隔数天才能再清洗一项，洗完后以日晒三天杀菌后再放入过滤系统。切记硝化菌的培养温床是不宜常清洗或更换的。
若担心硝化菌不足，则可再购置一外置滤水设备，在其内不要放白棉，仅放生化棉，陶瓷环与生化球，当作专用的硝化菌培养温床换或洗的时候，不要将滤材一次换掉，要小部份小部份的换，而且每换一样，要等三天再换另一样，较为妥当。否则硝化菌不够ph值一下变动太大，是很危险的。
水族硝化细菌，在水族界一直有用硝化细菌的传统，但目前已经不是传统意义上的硝化细菌。到目前为止，水族上的硝化细菌已经发展到第五代。
若过久没换水所造成的影响，主要有下例三点：
第一、硝酸盐及氨（阿摩尼亚）浓度易过高，水质易恶化。
第二、电解质也容易偏高。
第三、一旦换水就容易造成反溃（反水）现象，ph值急降。
